นมผงหรือ น้ำนมแม่ Joan Salge Blake นักโภชนาการจากมหาวิทยาลัยบอสตันกล่าวว่า การอุ่นนมผงหรือน้ำนมแม่ในไมโครเวฟอาจทำให้เกิดอุณหภูมิที่ไม่สม่ำเสมอ และบางส่วนอาจร้อนจัดจนเผาผิวทารกได้ องค์การอาหารและยาสหรัฐอเมริกา (FDA) ยังแนะนำว่าควรหลีกเลี่ยงการอุ่นน้ำนมแม่ในไมโครเวฟ เพราะจะทำให้สารอาหารสำคัญถูกทำลาย

ไก่ยัดไส้ Barbara Kowalcyk ศาสตราจารย์จากมหาวิทยาลัยจอร์จวอชิงตัน แนะนำว่าไม่ควรอุ่นไก่ยัดไส้หรืออาหารประเภทเดียวกันในไมโครเวฟ USDA ระบุว่าแม้เนื้อไก่จะอุ่นเร็ว แต่ไส้ด้านในอาจไม่ได้อุณหภูมิที่เหมาะสมพอจะฆ่าแบคทีเรียที่เป็นอันตราย ซึ่งอาจเพิ่มความเสี่ยงต่ออาหารเป็นพิษ

เนื้อสัตว์ดิบ การนำเนื้อสัตว์มาอบซอสในไมโครเวฟ เป็นเมนูง่ายๆ ที่หลายคนชอบทำ แต่เนื้อดิบอาจมีเชื้อโรคที่เป็นอันตราย การอุ่นในไมโครเวฟอาจมีความร้อนไม่เพียงพอในการฆ่าเชื้อ ดังนั้น ควรต้มให้สุกก่อน

อาหารเหลือที่เกิน 1 สัปดาห์ หากอาหารเหลือในตู้เย็นนานเกิน 7 วัน ควรทิ้งทันที FDA ระบุว่าอาหารเหลือที่เก็บไว้นานอาจมีเชื้อราและสารอันตรายอื่นๆ ซึ่งแม้จะอุ่นในไมโครเวฟก็ไม่ปลอดภัย USDA แนะนำว่าอาหารเหลือสามารถเก็บในตู้เย็นได้ 3-4 วันเท่านั้น

อาหารที่อยู่ในอุณหภูมิห้องเกิน 2 ชั่วโมง อาหารที่ถูกทิ้งไว้ในอุณหภูมิห้องเกิน 2 ชั่วโมง อาจมีแบคทีเรียที่ไม่สามารถถูกฆ่าได้ด้วยความร้อนสูง เช่น Staphylococcus aureus ที่ผลิตสารพิษที่ไม่สามารถกำจัดได้ หรือ Clostridium botulinum ที่เพิ่มจำนวนอย่างรวดเร็วและปล่อยสารพิษเข้าสู่อาหาร